sudo apt-get install gnome-tweak-tool
gnome-tweak-tool
Рабочий стол - Должен ли файловый менеджер управлять рабочим столом (have file manager handle the desktop) - вкл.

apt-get install --no-install-recommends gnome-panel
gnome-desktop-item-edit --create-new /home/"Пользователь"/Рабочий\ стол/

Ярлык для открытия программ
Приложение (Приложение для терминала/Адрес)
Имя: произвольно
Команда: /usr/bin/"Приложение"

Ярлык для открытия папок
На рабочем столе - Создать значок запуска
Имя: произвольно
Команда: xdg-open /media/"Пользователь"/"Путь"